É bastante comum nos jogos da série Zelda haver uma sequência de trocas de itens. A de Majora’s Mask é um tanto curta, mas se feita até o final vai render-lhe até seis pedaços de coração. Estes podem ser pegos paulatinamente ao longo do jogo, mas nesse caso, devido à mecânica de voltar no tempo, você precisará sempre refazer a sequência desde o início.
As trocas consistem em negociar com Business ScrubsMoitas Comerciantes suas flores particulares. Uma vez obtida a escritura, como novo dono você pode usar a forma de Deku Link para usar a propulsão da flor e alcançar o pedaço de coração próximo. Troque de escrituras com o Business ScrubMoita Comerciante seguinte e assim sucessivamente, na ordem que se segue.